Passo a partilhar a tradução para português deste excelente texto de Luis Falcon que chegou ao meu conhecimento no dia 31 de Março.
Reflexão: Há quantos anos andamos a perder autonomia, dinheiro, recursos humanos e técnicos com esta política de “submissão” às corporações detentoras de software proprietário que nos têm arruinado e posto em causa a independência da nossa comunidade.
É nesta altura de grave crise pandémica que todos os cidadãos e responsáveis políticos devem decidir romper com o status e pensar a sério no nosso futuro.
Introdução
O mundo está a enfrentar uma
das maiores crises sanitárias, económicas e sociais. Uma estrutura
minúscula de 50 nanómetros de diâmetro está ajoelhando as
economias mais poderosas do mundo, e centenas de milhares estão
tragicamente sucumbindo ao COVID-19.
Este artigo é um convite aos
governos para que adotem o GNU Health e Libre Software para benefício
do seu sistema público de saúde no contexto da pandemia de
COVID-19.
Para aqueles que já usam o
GNU Health, considerem este artigo como um tipo de diretriz para
otimizar a sua implementação e uso diário. Embora se concentre na
doença de COVID-19, a maioria dos tópicos será aplicada a qualquer
implementação do GNU Health.
Pessoas antes de pacientes: demografia e infraestrutura de saúde
Informação é poder. Dados
de boa qualidade e oportunos são cruciais para combater a pandemia
do COVID-19. O GNU Health foi desenvolvido para a
medicina social
. Ou seja, em vez de lidar diretamente com os pacientes, o GNU Health
trabalha primeiro nos principais pilares de uma sociedade. Como
resultado, o governo terá melhores ferramentas para promoção da
saúde e prevenção de doenças. O governo estará melhor preparado
para combater esta pandemia e futuros surtos.
Unidades Domiciliares
: DU são casas, apartamentos e edifícios onde as pessoas vivem. O
modelo GNU Health DU armazena a infraestrutura, as condições
sanitárias e as pessoas que moram
em
qualquer momento na casa, em tempo real
. Esse recurso é essencial para rastrear possíveis contatos de um
indivíduo infectado. Além disso, a infraestrutura, a superfície e
o número de cómodos fornecem grandes informações em termos de
possíveis condições de superlotação
que facilitariam a propagação da doença. Cada unidade domiciliar
pode ser georreferenciada
, graças ao link GNU Health OpenStreetMap
.
 | |
| Unidade Domiciliar em GNU Health: membros e sua geolocalização vinculada à OMS |
Áreas operacionais
: O GNU Health pode dividir um país em áreas e setores
administrativos (províncias, cidades, bairros, etc.) compostos por
unidades domiciliares e instituições de saúde.
O GNU Health pode fazer relatórios epidemiológicos em tempo real com base nesses
setores. A compreensão desse conceito é fundamental para os
programas de contenção ou mitigação do COVID-19, pois seria capaz
de identificar surtos iniciais em novas áreas ou focar em sessões
de incidência
relevante. As áreas e setores operacionais permitem-nos
encontrar correlações de muitos indicadores (etnia, sexo, idade,
rendimentos,
escolaridade, densidade populacional) na incidência, prevalência,
susceptibilidade à infecção ou progressão da doença no COVID-19.
Instituições de saúde
: o GNU Health pode acompanhar e gerenciar as instituições de saúde
em todo o país. Recursos humanos, gestão financeira e de “stocks”,
farmácias e laboratórios. No contexto da pandemia do COVID-19, é
possível fazer relatórios sobre os níveis de ocupação dessas
instituições, número de leitos, salas de operações, dispositivos
como ventiladores, número de profissionais de saúde e suas
especialidades, incidência, prevalência e mortalidade por
instituição, tempo médio de internação e muitos outros estudos.
Obviamente, você precisa ter as instituições criadas.
 |
| Modelo de instituição GNU Health |
Profissionais de saúde
: em crises como o COVID-19, GNU Health, o Ministério da Saúde
conhece cada profissional de saúde, as
suas especialidades, a instituição de
saúde onde trabalha e onde estão localizados (setores
operacionais). O tempo é precioso e manter as informações
atualizadas dos profissionais permitirá uma rápida atribuição.
Dados demográficos da
pessoa : idade, endereço e
unidades domiciliares, trabalho
e seguro
. Verifique se essas informações estão armazenadas. A
idade é um fator nesta
epidemia, pois o COVID-19 é particularmente pernicioso para a
população idosa
. A profissão da pessoa também é importante. Por exemplo, os
profissionais de saúde são o grupo mais alto infectado. A
demografia também ajudará a identificar pessoas sem cobertura de
saúde, desempregados, sem-abrigo
e outros grupos desfavorecidos que são particularmente vulneráveis.
 |
| Amostra de pirâmide populacional GH |
 |
| GH eval, extrato de relstório dx |
Contatos pessoais
: Para cada pessoa, o GNU Health regista seus contatos e relações
(trabalho, colegas de classe, amigos, colegas de classe). No cenário
de um caso positivo para COVID-19, essas informações permitiriam
chamar o paciente de contatos próximos. É essencial ter essas
informações atualizadas. Lembre-se de preencher todos os mecanismos
de contacto possíveis para cada pessoa (e-mail, telefone celular,
telegrama,…). Rastrear e entrar em contacto com a pessoa que mantém
contatos próximos é vital.
ID Universal da Pessoa
: Esse é um recurso essencial do GNU Health, especialmente no
contexto da Federação de Saúde GNU. O ID exclusivo da pessoa
(conta da federação) seria válido não apenas para a região ou
país, mas para todo o mundo. As informações clínicas podem estar
disponíveis e atualizadas em qualquer instituição de saúde do
país ou região, imediatamente disponível para o restante.
Triagem
A Organização
Mundial da Saúde (OMS) continua
dizendo "teste, teste, teste"
a população. Quanto mais cedo
testamos a população, melhor podemos controlar a propagação da
doença na comunidade. Grupos
populacionais especiais, como profissionais de saúde, idosos ou
pessoas com condições de saúde existentes devem ter prioridade.
Existem testes rápidos no
local de atendimento disponíveis em muitos países que podem
fornecer os resultados em menos de 30 minutos. Alguns deles cerca de
10 minutos. No GNU Health, você pode usar o tipo de teste de
laboratório para anticorpos SARS-CoV-2.
As estações de
trabalho GNU Health podem ser implantadas nas estações de teste
móveis e enviar as informações em tempo real ao Ministério da
Saúde, com o resultado assinado e validado.
Se a pessoa testou positivo para anticorpos IgM
, significa que ela está no estágio inicial da infecção. Os
anticorpos IgG se acumulam mais
tarde na infecção e fazem parte da "memória imunológica".
Se a IgM for positiva, você deve atualizar as condições de saúde,
incluir o código ICD10 a seguir e ativar o protocolo COVID-19 para
isolamento do paciente e rastreamento de contatos.
O código ICD10 para COVID-19
é U07.1
U07.1: doença
respiratória aguda 2019-nCoV
COVID-19:
Na GNU Health, a condição U07.1 (COVID-19) pertence aos grupos
de doenças infecciosas, respiratórias e notificáveis
.
Indique o tipo de teste de
laboratório e a ordem na condição relacionada.
 | |
| Amostra de ecrã do paciente GNU Health, incluindo informações críticas relacionadas com a doença de COVID-19 |
Gestão clínica
Se o paciente for testado
positivo, mas for clínico assintomático ou leve, ele poderá ser
enviado para casa para atendimento domiciliar. Por favor, verifique
naquele momento se a Unidade Domiciliar atende aos requisitos
(ventilação, número de cómodos, número de pessoas na casa,…).
Se a pessoa tiver testado
positivo e/ou apresentar sinais que justifiquem sua hospitalização,
interne-a na unidade de saúde e atribua-lhe uma cama na enfermaria
apropriada. Um novo prontuário será criado, com o correspondente
médico responsável, plano de tratamento e nutrição. Ao admitir um
paciente que sofre de COVID-19, é importante inserir seu código (
U07.1: 2019-nCoV doença
respiratória aguda COVID-19
) como o motivo da admissão e alta. Isso será muito valioso para
estatísticas.
Histórico Médico:
O histórico médico do paciente está pronto no GNU Health, a partir
de todas as avaliações dos pacientes nas diferentes instituições
de saúde. No contexto do COVID-19, essas informações são
essenciais, especialmente para pessoas com condições crónicas de
saúde, como doenças
cardiovasculares ou diabetes . A
medicação
atual e passada também é armazenada no GNU Health, além de
cirurgias.
Arredondamentos:
Para cada arredondamento, insira os sinais
vitais , a medicação
fornecida , avalie o ambiente e
os “Seis P” e registe todos os
procedimentos realizados
no próprio arredondamento. Além disso, se o
paciente estiver na Unidade de Terapia Intensiva.
Os sinais vitais podem ser
tomados em diferentes contextos. Eles podem ser avaliados em uma
avaliação ambulatorial, arredondamento de enfermeiros de internação
ou ambiente de UTI.
Unidade de Terapia
Intensiva : Se a progressão da
doença ameaçar a vida, o paciente será internado na Unidade de
Terapia Intensiva. O GNU Health possui um módulo de Unidade de
Terapia Intensiva. Após registar as principais informações do
arredondamento, vá para a guia “UTI” para obter uma avaliação
detalhada do paciente nesta unidade. Pontuações como Glasgow
Coma Scale e Apache
II estão disponíveis. Para cada
arredondamento na UTI, o profissional de saúde deve registar as
informações básicas e um RoS detalhado. O GNU Health permite
inserir informações de ECG e a cópia da faixa de ECG por
arredondamento, se necessário.
Uma percentagem de pacientes
hospitalizados pelo COVID-19 precisará de ventilação
mecânica. O
GNU Health regista o tipo e a duração da intubação
, por paciente em cada instituição. Esta informação é muito
valiosa tanto para a gestão clínica quanto para as
estatísticas. Hoje, a maioria dos países enfrenta a escassez de
ventiladores mecânicos. O GNU Health permite conhecer a incidência
de hospitalizações por COVID-19, bem como a taxa de alta.
Exames médicos e exames laboratoriais
Os achados radiológicos de
muitos pacientes com COVID-19 são compatíveis com pneumonia
atípica. Opacidades entremeadas, especialmente nas bases, são
achados comuns. Muitas pessoas com doenças leves não apresentam
sinais radiológicos.
O GNU Health fornece
diferentes tipos de testes de Dx. Imagens e observações são
registadas no sistema e vinculadas ao histórico do paciente. Além
do pacote padrão de radiologia de saúde GNU, o módulo de Terapia
Intensiva também permite adicionar imagens de raio X em cada
arredondamento para avaliar e comparar a progressão da doença.
Para imagens e estudos grandes, como
ressonância magnética ou tomografia computorizada, recomendamos o
pacote GNU Health Orthanc
. Orthanc é um fantástico servidor Libre DICOM e o GNU Health pode
interoperar com ele, graças à magia da filosofia do Software Livre.  |
| Radiologia da GNU Health. Achados compatíveis com pneumonia atípica num paciente COVID-19 |
Além dos tipos de teste de laboratório padrão
(hemograma, função renal e hepática ...), existem marcadores que
podem prever a progressão e a gravidade do COVID-19. Por exemplo,
altos níveis de ferritina, baixo
número de plaquetas e alta VHS
são comuns em pacientes que desenvolvem doenças graves e a síndrome
da tempestade de citocinas.
 |
| GNU Health LIMS exibindo uma amostra completa de hemograma |
Todos os resultados dos testes de laboratório
podem ser exportados para diferentes formatos. No contexto da GNU
Health Federation, um novo POL (Página da Vida) é criado e as
informações podem ser trocadas diretamente no formato JSON. As
figuras a seguir mostram o mesmo relatório de teste de laboratório
no formato PDF e JSON do servidor de mensagens da GNU Health
Federation (“Thalamus”)
Além dos testes realizados em pacientes
hospitalizados, lembre-se de que o pacote GNU Health LIMS pode ser
usado na triagem diagnóstica e populacional, como no caso de PCR e
testes rápidos.
Certificados de Óbito
O atestado de óbito é um
documento fundamental, pois possui significado legal,
administrativo, demográfico e epidemiológico.
A seguir, é apresentado um
exemplo de como podemos usar o Sistema
de Registo Vital de Saúde GNU
para gerar um atestado de óbito associado à doença de COVID-19.
A assinatura digital do certificado digital com o
profissional de saúde e/ou o oficial civil fará dele um documento
legal. O GNU Health usa o GNUPG (GNU Privacy Guard) para assinar e
criptografar digitalmente os documentos.
 |
| Secção de assinatura digital da certidão de óbito |
Pesquisa
Embora o sistema respiratório
seja o mais afetado em pacientes com COVID-19, outros órgãos podem
ser afetados. O receptor ACE2 (ponto de entrada da célula para
SARS-CoV-2) é expresso noutros tecidos além dos pulmões, como
cólon e coração. Não é de surpreender que tenham sido relatados
sintomas gastrointestinais e envolvimento cardíaco, como miocardite
aguda. Registar todas as descobertas ajudará a melhorar o manejo da
doença do paciente, mas também a compartilhar informações com
colegas da comunidade científica.
Compartilhar os tratamentos
dos pacientes e os resultados individuais ajudará a acelerar os
ensaios clínicos e a resposta a possíveis agentes terapêuticos
(por exemplo, remdesivir, lopinavir / ritonavir, hidroxicloroquina,
tocilizumabe ...)
 |
| A Federação de Saúde GNU conecta milhares de nós de instituições de saúde e pesquisa. |
Uma chamada para Open Science, Open Data e Libre Software
A atual pandemia do COVID-19 é
uma terrível tragédia para a humanidade, mas abre uma oportunidade
de cooperação, de união de forças e de nossa resiliência inata.
Existem muitas áreas cinzentas e muitas incertezas na origem do
vírus, progressão da doença e abordagens terapêuticas. . Por
outro lado, a Federação de Saúde GNU permite que a comunidade
científica se reúna e enfrente essa fera. Podemos compartilhar com
segurança uma quantidade enorme e anónima de informações de todo
o mundo para encontrar não apenas a base molecular da doença
COVID-19, mas também fatores ambientais e sociais que afetam a
suscetibilidade e a progressão da doença.
Estou voltando do Japão, onde
fui convidado para dar uma palestra no Centro de Inovação Médica
(MIC) da universidade de Kyoto. Foi uma honra compartilhar ideias com
estudantes e profissionais de uma instituição líder em biologia
molecular e biomedicina. Embora eu tenha falado sobre o GNU Health na
pesquisa de câncer, a minha apresentação focou-se na importância
da informática da Libre Health, ciência aberta, dados abertos em
Saúde Pública . Foi
surpreendentemente empolgante o grande nível de envolvimento do
público nestes tópicos.
Uma infraestrutura de
saúde pública robusta e sustentável deve ser baseada em
cooperação. A cooperação
envolve conhecimento aberto e ciência aberta. Estou convencido que a
verdadeira evolução vem da cooperação e não da competição.
Nesse sentido, nós, como membros da comunidade científica, devemos
compartilhar o nosso
trabalho, seja um código-fonte de um programa de computador, a
descoberta de uma variante natural de proteína ou o desenvolvimento
de uma nova molécula terapêutica.
O GNU Health usa a licença
GPL (General Public License), que permite transferir o programa, estudar
o código-fonte, adaptá-lo às necessidades do seu centro e
compartilhá-lo com a comunidade.
Lembre-se de que o software
livre não apenas oferece a liberdade coletiva, mas é a única maneira
de obter privacidade
nos serviços de saúde. Os programas
proprietários e não-livres são caixas pretas que comprometem a
privacidade pessoal e as informações de saúde pública. Além
disso, o uso de software proprietário em Saúde Pública é uma
contradição obscena.
Para alcançar a liberdade
coletiva, cada componente deve ser gratuito/gratuito. Ou seja, os
sistemas operativos (para servidores e clientes), bem como os
aplicativos em redor. Precisamos de compartilhar informações entre
colegas de todo o mundo, para que o formato que usamos nos arquivos
correspondentes também esteja aberto.
Enquanto isso, fique seguro.
Fique em casa!
Texto original
